Część tych środków trafi również na wspieranie badań nad szkodnikami roślin. W obszarze walki z chorobami zwierząt, 150 mln EUR trafi do 131 programów weterynaryjnych, obejmujących monitorowanie, kontrolę oraz zwalczanie. Znaczna część środków, tj. w wysokości około 56 mln EUR, zostanie przeznaczona na finansowanie programów walki z gruźlicą bydła.
Środki przeznaczone na walkę z chorobami wywoływanymi przez priony, a więc z gąbczastą encefalopatią bydła (BSE) oraz trzęsawką owiec zmniejszono do 9,3 mln EUR. Według FAMMU/FAPA, fundusze na walkę z brucelozą bydła wyniosą 9,6 mln EUR, brucelozą owiec i kóz - 9,4 mln EUR, a ze wścieklizną ustalono na poziomie blisko 25 mln EUR. W br. na programy związane ze zwalczaniem tzw. choroby niebieskiego języka trafi 8 mln EUR.
Na walkę z klasycznym pomorem świń oraz afrykańskim pomorem świń przeznaczono odpowiednio 2 mln EUR oraz 9,6 mln EUR, a na zwalczanie ptasiej grypy u drobiu i dzikich ptaków ponad 2 mln EUR. Poza tym, Unia przeznaczy prawie 19 mln EUR na walkę z chorobami odzwierzęcymi (zoonozami), takimi jak salmonelloza u kur hodowlanych i niosek, a także brojlerów i indyków. Unia będzie finansować programy zwalczania chorób zwierzęcych w wysokości 50%, z możliwością podniesienia pokrycia kosztów do 75% lub 100% w przypadku nadzwyczajnych sytuacji.